Nous montrons comment il est possible d'utiliser l'algorithme d'auto organisation de Kohonen pour traiter des donn\'ees avec valeurs manquantes et estimer ces derni\`eres. Apr\`es un rappel m\'ethodologique, nous illustrons notre propos \`a partir de trois applications \`a des donn\'ees r\'eelles. ----- We show how it is possible to use the Kohonen self-organizing algorithm to deal with data which contain missing values and to estimate them. After a methodological recall, we illustrate our purpose from three real databases applications.